在公司合并的情况下，员工的赔偿方式主要依据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，具体如下：
劳动合同继续有效
如果企业合并后并未与员工解除劳动关系，那么原劳动合同依然有效，新公司无需额外赔偿员工或支付经济补偿。这是因为《劳动合同法》第三十四条明确规定，用人单位发生合并或分立等情况时，原劳动合同继续有效，并由承继其权利和义务的用人单位继续履行。
解除劳动合同的经济补偿
若企业合并后解除劳动合同，且该解除属于《劳动合同法》第四十条规定的情形之一（如客观情况发生重大变化，导致劳动合同无法履行），企业则需依法向劳动者支付经济补偿。经济补偿的标准通常按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
违法解除劳动合同的赔偿金
若企业违法解除劳动合同，则应按经济补偿标准的两倍向劳动者支付赔偿金，以确保员工的合法权益得到充分保护。
企业合并导致合同变更
若因客观情况发生重大变化，导致企业与员工无法就劳动合同变更达成一致，企业则需依法支付经济补偿和额外一个月的工资，或提前三十日书面通知员工。
公司倒闭时的经济补偿
根据《劳动合同法》第四十七条的规定，企业倒闭时，应按照劳动者在企业的已工作年限支付经济补偿金。每满一年补偿一个月工资，不满半年补偿半个月工资，满半年不满一年则补偿一个月工资。对于月工资高于当地职工月平均工资三倍的劳动者，其经济补偿的标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，但支付年限最高不超过十二年。
其他形式的赔偿
除了上述经济补偿和赔偿金外，员工还可能获得其他形式的赔偿，比如失业保险金等，具体赔偿方式会根据当地的法律法规和公司的具体政策而定。
综上所述，公司合并后员工的赔偿方式主要取决于合并的具体情况、劳动合同的变更情况以及员工的工龄、工资等因素。建议企业在合并过程中，应充分与员工沟通，确保员工的合法权益得到妥善保障。
