股权转让的完税证明办理流程如下：
领取并填写申请表
到纳税地税务局窗口领取“完税证明”申请表。
填写申请表，并提供相关材料证明股权转让的相关情况，例如：购买协议、股权转让协议、税务机关出具的涉税调整通知书等。
提交申请及相关材料
将申请表和材料提交到纳税地税务局窗口。
税务机关收到申请后会进行核查和审核，并最终决定是否出具完税证明。
缴纳税款
确认应缴纳的税款数额。
通过网银或现场缴纳税款，并保存相关的交易凭证。
审核与开具完税证明
税务机关在逐一审核材料后，如真实无误会向申请方出具相应证明文件。
缴纳开具完税证明的相关费用。
登记纳税清单后，税务机关会在3天内开具完税证明。
领取完税证明
申请人到税务局领取完税证明或者委托别人领取。
建议
确保所有提供的材料真实、完整，并按照税务机关的要求进行提交。
在整个过程中，保持与税务机关的沟通，确保申请顺利进行。
如果遇到审核问题，及时咨询税务机关并补充所需材料。
